胸外科成立于2004年11月8日，是江门五邑地区医院中为数不多的拥有独立的胸外科专科和小儿外科专业的科室，短短的20年已跻身江门五邑地区的前列。学科人才储备充足、技术力量扎实雄厚、设备先进，集临床、教学为一体的高水平专业型学科。2023年6月评为江门市重点专科建设。全科开放床位39张，胸外科拥有一支技术精湛、专业覆盖全面、创新能力强的医疗队伍，有医师9人，护理11人，其中主任医师3名，副主任医师3名，主治医师2名，住院医师1名；副主任护师1名，主管护师2名。2023年全年手术量457例，四级手术量144例。长期与广州医科大学附属第一医院、广东省人民医院、珠江医院胸外科建立了良好的合作关系。 科室专注于胸外科及其小儿外科的各种疾病的诊断和治疗，包括但不限于：（胸外科）肺癌、肺结节、食管癌、纵隔肿瘤、胸腺瘤、脓胸、支气管扩张、气胸、肺大疱、手汗症、胸部创伤等；（小儿外科）肝母细胞瘤、先天性巨结肠、鞘膜积液、腹股沟斜疝、淋巴管瘤、血管瘤、急性阑尾炎、胆总管囊肿、巨输尿管、先天性输尿管囊肿等。科室技术先进，特色鲜明。遵循国际国内胸外科学科建设和发展的规律，形成了主要包括肺及支气管、食管、纵隔、胸壁、手汗症5个亚专科发展领域，同时也开展胸部创伤的急救及治疗。小儿外科目前有普外和泌尿2个亚专科。科室现已有江门市科技局立项10项，在国内及省内知名期刊发表39篇论文。